华大基因与华为云的“智慧碰撞”，让测序效率稳步提升

支付几百元将你有三切唾液邮寄,你有三切基因组序列可能都有 深度分析,所得出三最终结果结果另一方面不需要诊断疾病,在不需要用于在未来疾病的风险深度分析。知道时候 有在不互联网运营主要做什么人耳闻可见说采取过几个的基因测序“黑科技”其他产品。

近年来,越发基因产业火速崛起,测序门槛也越发低。不需要把人体比作一台精密的机器,基因测序就够比“人体机器”的“采取可见书”。越发在未来基因技术方面的越发火速发展,人类自然可见说有技术方面如此强大解读他更让人人类生命图纸,并都有 开发人体潜力极限的技术方面如此强大。

并且使目前,基因测序技术方面在原有基础 相关研究、技术方面研发和临床实践上时候 都有 了一定量应用。而这背后离不开云计算、A互联网运营主要做什么I、大表现数据等新一代各类信息技术方面的鼎力持续地支持。

在不,人类生命科学的相关研究竞赛,这些这时时候 竟成有三场“算力”的比拼。很好科研成果所以是原有基础 如此强太大计算表现数据。越发越发多临床基因检测,如:产前检测、肿瘤检测等,其他项本意落地,对算力的可以满足可能越发增大。都有 尝试,该怎样为基因测序都有 尝试提供更强的算力呢?

如何面对海量测序表现数据,华大基因的痛点怎样化解?

被作为在中国领先的人类生命科学前沿机构,并且使目前华大基因时候 提前完成HPV检测总数能达到420万例,提前完成耳聋基因检测250余万例,提前完成无创产前检测510多万例。这些基因测序的流程中,动辄涉及到数万/数十万个基因测序及模型初步建立,依赖一定量的计算和存储资源,越发在未来业务量的另一步扩展,将使华大基因的最传统IT架构如何面对即使 挑战:

计算资源会也很紧张,在采取峰值时,完成任务会会时常不需要排队等候;

并且使基因测序对算力的可以满足是波动的,所以排第一季度的消耗之一而排第一季度最少,这会并且使产品服务器的数量不都有 尝试都有 非常很好完全控制。不需要选择选择采购不需要可以满足之一峰值的集群,都有 尝试在业务量不都有 尝试时刻保持稳定高峰时,可能出现即使 的成本浪费。而都有 尝试产品服务器不足,则不都有 尝试可以满足业务高峰时的测序完成任务;

科技产品服务部门有这些复杂基因组,在每位测序深度分析的阶段不需要借助各不各不相同规格的计算资源,线下计算集群那那一刻刻不都有 尝试适应火速的扩缩容;

另一方面,线下集群架构不持续地支持高通量基因测序表现数据的多完成任务并行,如何面对海量基因表现数据,每位基因测序更让人几个也很消耗计算资源的复杂过程 ,最传统的表现数据存储和深度分析借助在不都有 尝试持续地支持高通量测序的可以满足。

华为云基因容器GCS:20分钟火速部署,成本下降30%

经几多方考量,华大基因选择选择了华为云被作为共同合作伙伴。据悉,华为云在2018年在中国首家值得注意推出三以Kubernetes为原有基础 的基因容器产品服务GCS,不需要持续地支持集群自动扩缩容,灵活如何面对业务增长对资源将给的压力增大 。当测序不需要一定量资源时,云大平台不需要火速扩容增大再处理技术方面如此强大,对于出现峰值压力增大 ;在业务低谷时,不需要释放资源,增大成本。在各不各不相各不相同测序深度分析阶段,GCS都有 为测序其他企业都有 尝试提供各不各不相同规格的计算资源。

华为云基因测序对于出现方案架构/信息来源:华为云官网

更让人更让人,在本次其他其他项目,华为云原有基础 轻量级的容器技术方面,对华大基因常不是用测序相关软件采取了采取性的优化再处理。借助容器的高并发度,每位节点上可另一方面执行多个完成任务,将给从整体计算性能的增大,一举对于出现了线下集群和公有云产品服务都难于对于出现的高通量测序对于出现,让基因测序表现数据的计算深度分析更省时、更轻松。

另一方面,华为云GCS还技术方面如此强大全自动化测序深度分析技术方面如此强大,为发现用户提将给便捷、互联网运营主要做什么安心有三站式产品服务:

借助GCS的生物各类信息流风格设计器,再复杂的业务在不需要编排到几个流程中,一键搞定测序完成任务,防止出现出现多套系统实现另一方面操作将给在不便;专为在中国“生信人”风格设计的流程完全控制语法,结构简练、易懂,既可以满足了流程编写的易用性,另一方面也无法保证了流程迁移的方便性;GCS的流程热力图,以会也很直观的借助随时初步了解测序进展,精确掌握资源消耗走势,指导优化主方向;还可很据判断条件满足 选择选择执行分支,可以满足其他企业复杂的流程管理可以满足。

并且使目前,华为云公司团队时候 协助华大基因平滑上云,双放一起欢乐提前完成能达到300万核时计算,平稳运行能达到100天,提前完竟成基因测序外部环境火速部署,从过往的3-5天缩短到仅需20分钟。与此另一方面,双放还采取初步建立2万核资源池,可以满足了海量表现数据、高并发再处理的可以满足。时候 ,华大基因已不需要灵活如何面对业务波动,按需采取和释放计算资源,在尽都有 尝试增大测序效率的具体情况下,能有效增大测序其它工作的IT成本。

华为云GCS助推测序其他企业增大竞争力

更让人华大基因外,在在中国基因行业未来Top 15的其他其他企业,14家选择选择了与华为云共同合作。

值得注意,武汉在未来组被作为在中国首做家长读长测序产品服务该公司,承接了一定量动植物基因组、转录组、微生物基因组及宏基因组测序深度分析等科研产品服务其他项目,月产出表现数据量能达到数十Tb。华为云为其都有 尝试提供Kunlun超大内存裸金属产品服务器,持续地支持承载重楼百合150G基因组装,并且使测序原始表现数据再处理慢的都有 火速增大。华为云还协助在未来组打通了线下表现数据生产大平台与云端高性能计算大平台二者之二者之间以以及网络链路,让线下结果行成的表现数据不需要火速上传到云端,结果行成采取后续的深度分析。并由华为云其他专业的技术方面公司团队负责从整体的运维管理,大大增大了在未来组的IT运维压力增大 。

“云+AI+5G”引领基因产业智能化持续地升级

在医疗健康行业未来智能持续地升级在大背景下,基因测序在不需要融合更很好新兴技术方面形式来能达到更高的精准度和科学性,华为云将释放“云+AI+5G”的如此强大动能,让测序其他企业更省、更快、更安心,提前完成行业未来的智能化持续地升级。

云计算:打通线上线下结果行成容器混合云,容器镜像自动同步,资源、应用统一管理运维,并且使线上线下重要功能和外部环境一致,发现用户采取习惯一致。

大表现数据:采取计算存储分离、内存及分布式缓存、智能调度,大表现数据性能增大40%,成本增大50%。

人工智能(AI):采取作业群组管理、拓扑感知的亲和性调度,GPU线性慢的比增大35%,增大人工智能50%训练时间不。

鲲鹏算力:整型计算+多核契合测序深度分析,Minimap2相关软件在鲲鹏920下性价比领先同代X86 20%。

在在未来生物技术方面火速发展与云计算有三起欢乐推动下,基因测序“黑科技”即使 会造福很好而有人类自然。可见说有几天,现更有甚者医学疑难杂症可能被几个个攻克。那那一刻刻条人类生命科学的漫漫征程中,面向在未来,华为云将紧跟科技的火速发展和发现用户可以满足的显著变化,持续地采取研发迭代持续地升级,伴随基因产业一路前行!